L'ecotossicologia è una disciplina trasversale che si avvale della chimica ambientale, della tossicologia e dell'ecologia:
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la chimica ambientale studia il movimento, il trasporto e le trasformazioni delle sostanze chimiche nell'ambiente
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la tossicologia ambientale (derivante dalla tossicologia classica) fornisce gli strumenti per la valutazione del danno (sia a livello di specie, sia a quello su sistemi biologici complessi)
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l'ecologia indica quali processi chiave caratterizzano i molteplici sistemi e quali relazioni intercorrono tra gli organismi e il supporto non vivente che li ospita